A tragikus hirtelenséggel, életének 53. évében december 29-én autóbalesetben elhunyt Gyöngyössy Zoltánt a Liszt Ferenc Zeneművészeti Egyetem és Újpest Önkormányzata egyaránt saját halottjának tekinti.

Gyöngyössy Zoltán ihletett előadója volt a kiváló magyar kortárs zeneszerzők műveinek, Kurtág György és Kurtág Márta úgy fogalmazott: megtiszteltetés, hogy kompozícióikat a fuvolaművész játszotta lemezre.

Megszólaltatta Szöllősy András, Sári László és mások alkotásait is.

Gyöngyössy Zoltán 1958. február 20-án született. Alapfokú tanulmányait a híres komlói Kodály Zoltán Általános Iskolában kezdte, 1972-től a pécsi Művészeti Szakközépiskolában folytatta. 1976-tól Pröhle Henriknél tanult a Zeneakadémia fuvola szakán, ahol Pernye András, Kistétényi Melinda, Láng István, Kurtág György és Simon Albert is a tanárai közé tartozott. 1981-ben kitüntetéssel diplomázott.

Tagja volt a Claudio Abbado vezette Európa Kamarazenekarnak, kezdetben a Budapesti Fesztiválzenekarnak; rendszeresen részt vett a Szombathelyi Bartók Szeminárium és Fesztivál munkájában. Játszott a Componensemble, az UMZE és az Intermoduláció együttessel.

Számos kortárs zeneszerző ajánlotta neki darabját. Többször is elnyerte az Artisjus díját, 1993-ban Liszt Ferenc-díjat kapott.