John Warhola karácsonykor hunyt el 85 évesen Pittsburghben, halálát tüdőgyulladás okozta. Abban a kórházban kezelték, amely mindössze pár háztömbnyire fekszik a Warhol Múzeumtól.

Andy Warhol idősebb testvére egyike volt a pop-art apostolának emlékét őrző alapítvány létrehozóinak, húsz évig az intézmény alelnökeként tevékenykedett. Az alapítvány hozta létre 1994-ben a művész munkásságának szentelt Múzeumot Pittsburgh városában.

A családfő Andrij Warhola 1942-ben bekövetkezett halála után John (Ján) Warhola viselte gondját öccsének, gondoskodott taníttatásáról is. Andy Warhol számára testvére egyfajta apafigura lett - mondta John Warhola fia.